翻译后修饰位点鉴定
技术原理
蛋白质翻译后修饰(Protein post-Translational Modification,PTM)在生命体中具有十分重要的作用,与基因表达、信号传导通路、细胞分裂等进程密切相关。同一蛋白在不同生理状态、不同亚细胞定位、不同氨基酸位点的修饰,可能对应不同的功能。因此蛋白质翻译后修饰是当前的一个研究热点和难点。一般常见的修饰类型主要有磷酸化、甲基化、乙酰化、生物素化、磷酸化、糖基化、泛素化、二硫键等多种翻译后修饰类型。
翻译后修饰位点鉴定的技术原理:先通过IP得到目的蛋白,再通过SDS-PAGE对目的蛋白进行分离纯化,将胶条上目的蛋白对应的条带切下进行胶内酶解和高灵敏度的液质联用分析(LC-MS/MS),通过数据库检索得到蛋白上的修饰位点。
翻译后修饰位点鉴定技术原理图
技术特点
l 针对不同的修饰类型采取不同的富集方式;
l 富集效率高,可提高修饰肽段的检测效率;
l 基于高精度的质谱分析,可对修饰位点进行精确鉴定;
l 可对多种修饰类型进行鉴定。
样品要求
l SDS-PAGE胶条:银染、考染条带可见;
l 蛋白质溶液:蛋白质总量>5μg,浓度>0.1μg/μl。
注意事项
l 在蛋白质制备过程中使组织始终置于冰上,离心机、离心管等仪器设备要提前预冷,以防蛋白质的降解;
l 对预处理好的材料,若不立即进行实验,应冷冻保存(-80℃),对于易分解的生物大分子应选用新鲜材料制备。
项目报告
l 实验步骤
l 质谱参数
l 质谱谱图
l 蛋白质修饰位点的鉴定信息
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