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棕榈酰化修饰位点鉴定
 服务介绍
棕榈酰化修饰(S-palmitoylation)是指长链脂肪酸(通常是指16个碳的棕榈酸)通过硫酯键共价修饰到蛋白质半胱氨酸残基上,这是一种广泛存在于生物体内动态、可逆的翻译后修饰形式,在调控蛋白质的转运、细胞定位和稳定性等方面都具有非常重要的作用,并与许多疾病的发生、发展关系密切。因此,对棕榈酰化修饰蛋白质组(包括修饰位点)的鉴定分析具有很重要的意义。
由于棕榈酰化修饰疏水性强,缺少商品化棕榈酰化修饰的抗体;且通常发生在中低丰度的蛋白质上,在质谱分析过程中,会受到非棕榈酰化修饰蛋白质/肽段的影响,进而产生严重的信号抑制。因此,需要先对棕榈化修饰的蛋白进行富集处理,然后通过LC-MS/MS蛋白质定量方法,实现对棕榈化修饰蛋白的鉴定分析。
 

蛋白质棕榈酰化化学结构示意图

技术路线
生物棕榈酰化修饰组学检测采用经典的ABE法,即首先用N-乙基马来酰亚胺阻断游离巯基;接着羟胺处理以释放硫酯连接的棕榈酰部分,将修饰的半胱氨 酸恢复为巯基;然后使用生物素-HPDP标记羟胺新暴露的硫醇;接着使用链霉亲和素-琼脂糖亲和纯化生物素化的蛋白质,酶解蛋白形成短肽并通过高分辨质谱仪器鉴定棕榈酰化的蛋白质和修饰位点。

 

棕榈酰化修饰位点鉴定技术原理图

技术优势
l  操作容易简单:不需同位素标记,实验流程简单
l  高精度与准确性:可鉴定分析具体修饰位点,采用超高分辨质谱仪,获取更多肽段信息,找到更多修饰位点
l  检测范围广:可检测各种细胞或者组织中的棕榈酰化修饰位点
 
应用方向
l  全面揭示生理病理条件下的蛋白棕榈酰化特征
l  生理病理分子机制挖掘
l  棕榈酰化和磷酸化/泛素化等修饰的crosstalk
 
样品要求
l  植物组织样品>500mg,动物组织样品>20mg;
l  血液样品至少2ml;
l  尿液样品>10ml;
l  细胞样品>5x108个细胞;
l  微生物样品干重500mg。
 
注意事项
l  请使用足量的干冰运输,并尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性。
 
项目报告
l  实验步骤
l  质谱参数
l  质谱谱图
l  鉴定的棕榈化位点详细信息
 
棕榈化修饰位点鉴定一站式服务
l  您只需下单-寄送样品
l  明德正康为您完成-样品处理-上机分析-数据分析-项目报告
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